Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COL19A1Q14993 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.7 ms