Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
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SSPNQ14714 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
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SSPNQ14714 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
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SSPNQ14714 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
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SSPNQ14714 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
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SSPNQ14714 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
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SSPNQ14714 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
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SSPNQ14714 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
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