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| SEMA3A | Q14563 | AL390240.1-201 | ENST00000612950 | 384 nt | BASIC | 3.79 | □□□□□ -1.8 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC091905.1-201 | ENST00000624400 | 311 nt | BASIC | 3.79 | □□□□□ -1.8 | | |
| SEMA3A | Q14563 | BX088723.1-201 | ENST00000637785 | 708 nt | TSL 5 BASIC | 3.79 | □□□□□ -1.8 | | |
| SEMA3A | Q14563 | DNAJC10-201 | ENST00000264065 | 20129 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.79 | □□□□□ -1.8 | | |
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| SEMA3A | Q14563 | ATXN3-248 | ENST00000558190 | 26812 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
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| SEMA3A | Q14563 | BCLAF1-213 | ENST00000530767 | 4186 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
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| SEMA3A | Q14563 | RPL7P26-201 | ENST00000333817 | 754 nt | BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
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| SEMA3A | Q14563 | RNU4-73P-201 | ENST00000363164 | 141 nt | BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNA5SP515-201 | ENST00000364570 | 118 nt | BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| SEMA3A | Q14563 | Y_RNA.263-201 | ENST00000364659 | 114 nt | BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
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| SEMA3A | Q14563 | RN7SL93P-201 | ENST00000463035 | 293 nt | BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC012181.1-201 | ENST00000479895 | 423 nt | BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RN7SL323P-201 | ENST00000494712 | 295 nt | BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| SEMA3A | Q14563 | HMGB1P29-201 | ENST00000505659 | 499 nt | BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MDM4-213 | ENST00000507825 | 481 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RN7SKP13-201 | ENST00000515933 | 244 nt | BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RN7SKP21-201 | ENST00000516503 | 220 nt | BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL133271.1-201 | ENST00000538229 | 291 nt | BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL160237.1-201 | ENST00000554526 | 572 nt | TSL 4 BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL157687.1-201 | ENST00000554853 | 619 nt | BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC009292.2-201 | ENST00000558889 | 291 nt | TSL 5 BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC012669.1-201 | ENST00000603209 | 283 nt | BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| SEMA3A | Q14563 | SNORA62.6-201 | ENST00000606322 | 83 nt | BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC083798.2-205 | ENST00000608015 | 575 nt | TSL 5 BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC068831.8-201 | ENST00000620171 | 435 nt | BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL732618.1-201 | ENST00000623251 | 301 nt | BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC091953.2-201 | ENST00000623979 | 160 nt | BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |