Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SEMA3AQ14563 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SEMA3AQ14563 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SEMA3AQ14563 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SEMA3AQ14563 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SEMA3AQ14563 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SEMA3AQ14563 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SEMA3AQ14563 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SEMA3AQ14563 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SEMA3AQ14563 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SEMA3AQ14563 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SEMA3AQ14563 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SEMA3AQ14563 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SEMA3AQ14563 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SEMA3AQ14563 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SEMA3AQ14563 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SEMA3AQ14563 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SEMA3AQ14563 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SEMA3AQ14563 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SEMA3AQ14563 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SEMA3AQ14563 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SEMA3AQ14563 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SEMA3AQ14563 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SEMA3AQ14563 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SEMA3AQ14563 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SEMA3AQ14563 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SEMA3AQ14563 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SEMA3AQ14563 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SEMA3AQ14563 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SEMA3AQ14563 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SEMA3AQ14563 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SEMA3AQ14563 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SEMA3AQ14563 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SEMA3AQ14563 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SEMA3AQ14563 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SEMA3AQ14563 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SEMA3AQ14563 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SEMA3AQ14563 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SEMA3AQ14563 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SEMA3AQ14563 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SEMA3AQ14563 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SEMA3AQ14563 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SEMA3AQ14563 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SEMA3AQ14563 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SEMA3AQ14563 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SEMA3AQ14563 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SEMA3AQ14563 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SEMA3AQ14563 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SEMA3AQ14563 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SEMA3AQ14563 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SEMA3AQ14563 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SEMA3AQ14563 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SEMA3AQ14563 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SEMA3AQ14563 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SEMA3AQ14563 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SEMA3AQ14563 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SEMA3AQ14563 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SEMA3AQ14563 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SEMA3AQ14563 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SEMA3AQ14563 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SEMA3AQ14563 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
SEMA3AQ14563 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
SEMA3AQ14563 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
SEMA3AQ14563 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SEMA3AQ14563 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SEMA3AQ14563 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SEMA3AQ14563 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SEMA3AQ14563 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SEMA3AQ14563 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SEMA3AQ14563 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SEMA3AQ14563 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SEMA3AQ14563 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SEMA3AQ14563 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SEMA3AQ14563 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SEMA3AQ14563 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SEMA3AQ14563 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SEMA3AQ14563 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SEMA3AQ14563 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SEMA3AQ14563 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SEMA3AQ14563 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SEMA3AQ14563 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SEMA3AQ14563 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SEMA3AQ14563 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SEMA3AQ14563 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SEMA3AQ14563 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SEMA3AQ14563 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SEMA3AQ14563 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SEMA3AQ14563 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
SEMA3AQ14563 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SEMA3AQ14563 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SEMA3AQ14563 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SEMA3AQ14563 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SEMA3AQ14563 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SEMA3AQ14563 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SEMA3AQ14563 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SEMA3AQ14563 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SEMA3AQ14563 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SEMA3AQ14563 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SEMA3AQ14563 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SEMA3AQ14563 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.5 ms