Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SPIDRQ14159 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SPIDRQ14159 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SPIDRQ14159 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SPIDRQ14159 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SPIDRQ14159 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SPIDRQ14159 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SPIDRQ14159 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SPIDRQ14159 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SPIDRQ14159 DHFRP3-201ENST00000455595 559 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SPIDRQ14159 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SPIDRQ14159 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SPIDRQ14159 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SPIDRQ14159 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SPIDRQ14159 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
SPIDRQ14159 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SPIDRQ14159 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SPIDRQ14159 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SPIDRQ14159 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SPIDRQ14159 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SPIDRQ14159 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SPIDRQ14159 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SPIDRQ14159 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SPIDRQ14159 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SPIDRQ14159 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SPIDRQ14159 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SPIDRQ14159 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SPIDRQ14159 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SPIDRQ14159 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SPIDRQ14159 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SPIDRQ14159 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SPIDRQ14159 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SPIDRQ14159 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SPIDRQ14159 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SPIDRQ14159 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SPIDRQ14159 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SPIDRQ14159 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
SPIDRQ14159 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
SPIDRQ14159 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SPIDRQ14159 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SPIDRQ14159 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SPIDRQ14159 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SPIDRQ14159 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
SPIDRQ14159 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SPIDRQ14159 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
SPIDRQ14159 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SPIDRQ14159 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SPIDRQ14159 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SPIDRQ14159 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SPIDRQ14159 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SPIDRQ14159 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SPIDRQ14159 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SPIDRQ14159 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SPIDRQ14159 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SPIDRQ14159 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SPIDRQ14159 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SPIDRQ14159 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SPIDRQ14159 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SPIDRQ14159 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SPIDRQ14159 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SPIDRQ14159 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SPIDRQ14159 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SPIDRQ14159 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SPIDRQ14159 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SPIDRQ14159 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SPIDRQ14159 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SPIDRQ14159 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SPIDRQ14159 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SPIDRQ14159 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SPIDRQ14159 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SPIDRQ14159 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SPIDRQ14159 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SPIDRQ14159 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SPIDRQ14159 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SPIDRQ14159 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SPIDRQ14159 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SPIDRQ14159 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SPIDRQ14159 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SPIDRQ14159 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SPIDRQ14159 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SPIDRQ14159 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SPIDRQ14159 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SPIDRQ14159 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SPIDRQ14159 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SPIDRQ14159 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SPIDRQ14159 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SPIDRQ14159 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SPIDRQ14159 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SPIDRQ14159 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SPIDRQ14159 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
SPIDRQ14159 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SPIDRQ14159 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SPIDRQ14159 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
SPIDRQ14159 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
SPIDRQ14159 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.4 ms