Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC4.11□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC4.11□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 AC005908.2-201ENST00000546078 530 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
UBE4AQ14139 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
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