Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 AC092994.1-201ENST00000498604 279 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 ALDH3A2-208ENST00000571163 590 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CKAP5Q14008 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.2 ms