Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 AC006116.4-201ENST00000589671 452 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 AC073111.2-201ENST00000605657 1075 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 AP003072.5-201ENST00000623872 773 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 OR5T1-202ENST00000641665 1471 ntAPPRIS P1 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 FO393415.3-201ENST00000456424 375 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 NUCB2-202ENST00000458064 1279 ntTSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 DENND6A-AS1-201ENST00000470427 364 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 AC112211.1-201ENST00000607832 305 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 ARL2BPP3-201ENST00000421226 480 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 Z99289.1-206ENST00000425503 393 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC1.25□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 AL513321.1-201ENST00000441175 761 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 AC135178.6-201ENST00000605314 398 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 AC004022.2-201ENST00000413824 193 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 AC021087.2-201ENST00000504656 1203 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 AC107398.1-201ENST00000486904 505 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 AC108120.2-201ENST00000512973 294 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 AC020658.4-201ENST00000613987 684 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 HSFY1P1-202ENST00000425038 1381 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
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