Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 ARL1-211ENST00000551828 776 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 AC010680.3-201ENST00000604215 520 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
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PKP1Q13835 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
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