Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CUL4AQ13619 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CUL4AQ13619 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CUL4AQ13619 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CUL4AQ13619 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CUL4AQ13619 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CUL4AQ13619 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CUL4AQ13619 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CUL4AQ13619 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
CUL4AQ13619 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
CUL4AQ13619 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CUL4AQ13619 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CUL4AQ13619 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CUL4AQ13619 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CUL4AQ13619 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL4AQ13619 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL4AQ13619 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL4AQ13619 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL4AQ13619 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL4AQ13619 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL4AQ13619 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL4AQ13619 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL4AQ13619 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL4AQ13619 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL4AQ13619 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL4AQ13619 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL4AQ13619 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL4AQ13619 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL4AQ13619 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL4AQ13619 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL4AQ13619 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL4AQ13619 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL4AQ13619 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL4AQ13619 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL4AQ13619 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL4AQ13619 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL4AQ13619 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL4AQ13619 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL4AQ13619 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL4AQ13619 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL4AQ13619 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL4AQ13619 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL4AQ13619 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL4AQ13619 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL4AQ13619 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL4AQ13619 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL4AQ13619 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL4AQ13619 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL4AQ13619 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL4AQ13619 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL4AQ13619 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL4AQ13619 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL4AQ13619 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL4AQ13619 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL4AQ13619 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL4AQ13619 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL4AQ13619 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL4AQ13619 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL4AQ13619 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL4AQ13619 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL4AQ13619 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL4AQ13619 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL4AQ13619 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL4AQ13619 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL4AQ13619 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL4AQ13619 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CUL4AQ13619 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
CUL4AQ13619 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
CUL4AQ13619 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
CUL4AQ13619 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CUL4AQ13619 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CUL4AQ13619 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CUL4AQ13619 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CUL4AQ13619 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CUL4AQ13619 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CUL4AQ13619 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CUL4AQ13619 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
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CUL4AQ13619 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CUL4AQ13619 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CUL4AQ13619 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CUL4AQ13619 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CUL4AQ13619 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CUL4AQ13619 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CUL4AQ13619 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CUL4AQ13619 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CUL4AQ13619 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CUL4AQ13619 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CUL4AQ13619 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CUL4AQ13619 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CUL4AQ13619 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CUL4AQ13619 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CUL4AQ13619 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CUL4AQ13619 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CUL4AQ13619 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CUL4AQ13619 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CUL4AQ13619 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CUL4AQ13619 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CUL4AQ13619 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CUL4AQ13619 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
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