Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC3.96□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC3.96□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC3.96□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 KCTD9P3-201ENST00000434597 1169 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 NARSP2-201ENST00000518524 679 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
TUBB3Q13509 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 166.9 ms