Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 LINC01729-201ENST00000450640 358 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.4 ms