Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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BNIP1Q12981 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
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BNIP1Q12981 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
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BNIP1Q12981 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
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BNIP1Q12981 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
BNIP1Q12981 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
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BNIP1Q12981 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
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BNIP1Q12981 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
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BNIP1Q12981 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
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BNIP1Q12981 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
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BNIP1Q12981 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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BNIP1Q12981 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
BNIP1Q12981 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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