Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 AC010601.1-202ENST00000567304 547 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 AC093581.1-202ENST00000430890 391 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.6 ms