Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 MTCO2P9-201ENST00000503214 694 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 KATNBL1P4-201ENST00000503545 918 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 AL512504.1-201ENST00000415494 778 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 HMGB1P47-201ENST00000511281 589 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 AL359094.1-201ENST00000627944 566 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 AC015908.1-201ENST00000478739 476 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 AC074029.2-201ENST00000551045 634 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 LINC01967-202ENST00000437506 515 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 LNCPRESS2-201ENST00000502518 616 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 AC025768.1-201ENST00000510057 267 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 AC067805.1-201ENST00000559344 470 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 AL391597.1-201ENST00000618707 694 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 AC078857.1-201ENST00000469870 667 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 AC090912.2-203ENST00000581177 477 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 AC079610.2-201ENST00000604818 690 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 HPVC1-201ENST00000629899 1198 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 MTND4P8-201ENST00000514997 1362 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
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