Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
BRPF3Q9ULD4 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
BRPF3Q9ULD4 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
BRPF3Q9ULD4 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
BRPF3Q9ULD4 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
BRPF3Q9ULD4 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
BRPF3Q9ULD4 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
BRPF3Q9ULD4 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
BRPF3Q9ULD4 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
BRPF3Q9ULD4 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
BRPF3Q9ULD4 AC025164.1-201ENST00000496249 478 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
BRPF3Q9ULD4 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
BRPF3Q9ULD4 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
BRPF3Q9ULD4 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
BRPF3Q9ULD4 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
BRPF3Q9ULD4 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
BRPF3Q9ULD4 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
BRPF3Q9ULD4 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
BRPF3Q9ULD4 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
BRPF3Q9ULD4 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
BRPF3Q9ULD4 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
BRPF3Q9ULD4 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
BRPF3Q9ULD4 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
BRPF3Q9ULD4 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
BRPF3Q9ULD4 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
BRPF3Q9ULD4 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
BRPF3Q9ULD4 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
BRPF3Q9ULD4 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
BRPF3Q9ULD4 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
BRPF3Q9ULD4 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
BRPF3Q9ULD4 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
BRPF3Q9ULD4 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
BRPF3Q9ULD4 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
BRPF3Q9ULD4 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
BRPF3Q9ULD4 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
BRPF3Q9ULD4 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
BRPF3Q9ULD4 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
BRPF3Q9ULD4 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
BRPF3Q9ULD4 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
BRPF3Q9ULD4 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
BRPF3Q9ULD4 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
BRPF3Q9ULD4 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
BRPF3Q9ULD4 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
BRPF3Q9ULD4 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
BRPF3Q9ULD4 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
BRPF3Q9ULD4 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
BRPF3Q9ULD4 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
BRPF3Q9ULD4 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
BRPF3Q9ULD4 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
BRPF3Q9ULD4 OR5D15P-201ENST00000531671 942 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
BRPF3Q9ULD4 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
BRPF3Q9ULD4 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
BRPF3Q9ULD4 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
BRPF3Q9ULD4 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
BRPF3Q9ULD4 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
BRPF3Q9ULD4 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
BRPF3Q9ULD4 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
BRPF3Q9ULD4 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
BRPF3Q9ULD4 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
BRPF3Q9ULD4 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
BRPF3Q9ULD4 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
BRPF3Q9ULD4 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
BRPF3Q9ULD4 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
BRPF3Q9ULD4 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
BRPF3Q9ULD4 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
BRPF3Q9ULD4 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
BRPF3Q9ULD4 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
BRPF3Q9ULD4 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
BRPF3Q9ULD4 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
BRPF3Q9ULD4 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
BRPF3Q9ULD4 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
BRPF3Q9ULD4 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BRPF3Q9ULD4 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BRPF3Q9ULD4 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BRPF3Q9ULD4 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BRPF3Q9ULD4 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BRPF3Q9ULD4 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BRPF3Q9ULD4 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BRPF3Q9ULD4 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BRPF3Q9ULD4 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
BRPF3Q9ULD4 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BRPF3Q9ULD4 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BRPF3Q9ULD4 RN7SL610P-201ENST00000463845 291 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BRPF3Q9ULD4 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
BRPF3Q9ULD4 AC083982.1-201ENST00000485679 344 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BRPF3Q9ULD4 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BRPF3Q9ULD4 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BRPF3Q9ULD4 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BRPF3Q9ULD4 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
BRPF3Q9ULD4 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
BRPF3Q9ULD4 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BRPF3Q9ULD4 AP001011.1-202ENST00000581172 667 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
BRPF3Q9ULD4 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BRPF3Q9ULD4 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BRPF3Q9ULD4 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BRPF3Q9ULD4 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
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