Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms