Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 LARP1BP1-201ENST00000506036 1359 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 AC096554.1-201ENST00000458182 529 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
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