Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD1Q9GZZ0 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.3 ms