Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 AC073592.7-201ENST00000623659 507 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 AL158050.1-201ENST00000416077 457 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 AC104229.1-201ENST00000561364 255 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 AC006213.5-201ENST00000619673 288 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 AC097460.3-201ENST00000623099 442 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC2.53□□□□□ -2.01
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ZBED3Q96IU2 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ZBED3Q96IU2 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ZBED3Q96IU2 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
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ZBED3Q96IU2 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
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ZBED3Q96IU2 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ZBED3Q96IU2 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ZBED3Q96IU2 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
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ZBED3Q96IU2 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ZBED3Q96IU2 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
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ZBED3Q96IU2 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ZBED3Q96IU2 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
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ZBED3Q96IU2 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ZBED3Q96IU2 AC005776.1-201ENST00000603164 290 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
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ZBED3Q96IU2 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ZBED3Q96IU2 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ZBED3Q96IU2 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ZBED3Q96IU2 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
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ZBED3Q96IU2 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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ZBED3Q96IU2 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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ZBED3Q96IU2 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
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ZBED3Q96IU2 AC098483.2-201ENST00000603158 454 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ZBED3Q96IU2 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ZBED3Q96IU2 AC026741.1-201ENST00000605892 482 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ZBED3Q96IU2 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ZBED3Q96IU2 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ZBED3Q96IU2 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ZBED3Q96IU2 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ZBED3Q96IU2 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
ZBED3Q96IU2 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
ZBED3Q96IU2 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZBED3Q96IU2 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZBED3Q96IU2 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZBED3Q96IU2 SNORD56.4-201ENST00000363883 71 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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