Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TRIM63Q969Q1 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
TRIM63Q969Q1 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TRIM63Q969Q1 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TRIM63Q969Q1 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TRIM63Q969Q1 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
TRIM63Q969Q1 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TRIM63Q969Q1 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TRIM63Q969Q1 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
TRIM63Q969Q1 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TRIM63Q969Q1 KCTD9P3-201ENST00000434597 1169 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TRIM63Q969Q1 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TRIM63Q969Q1 AL139327.2-202ENST00000437057 400 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
TRIM63Q969Q1 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TRIM63Q969Q1 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
TRIM63Q969Q1 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
TRIM63Q969Q1 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TRIM63Q969Q1 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
TRIM63Q969Q1 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
TRIM63Q969Q1 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TRIM63Q969Q1 RPL7P19-201ENST00000469948 618 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TRIM63Q969Q1 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
TRIM63Q969Q1 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
TRIM63Q969Q1 AC106872.4-201ENST00000510050 523 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TRIM63Q969Q1 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TRIM63Q969Q1 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TRIM63Q969Q1 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
TRIM63Q969Q1 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TRIM63Q969Q1 UBE2FP2-201ENST00000566646 462 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TRIM63Q969Q1 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TRIM63Q969Q1 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TRIM63Q969Q1 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
TRIM63Q969Q1 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
TRIM63Q969Q1 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TRIM63Q969Q1 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TRIM63Q969Q1 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TRIM63Q969Q1 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TRIM63Q969Q1 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
TRIM63Q969Q1 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TRIM63Q969Q1 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
TRIM63Q969Q1 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TRIM63Q969Q1 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
TRIM63Q969Q1 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
TRIM63Q969Q1 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
TRIM63Q969Q1 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
TRIM63Q969Q1 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TRIM63Q969Q1 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TRIM63Q969Q1 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
TRIM63Q969Q1 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
TRIM63Q969Q1 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRIM63Q969Q1 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRIM63Q969Q1 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRIM63Q969Q1 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRIM63Q969Q1 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TRIM63Q969Q1 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRIM63Q969Q1 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRIM63Q969Q1 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TRIM63Q969Q1 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRIM63Q969Q1 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TRIM63Q969Q1 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TRIM63Q969Q1 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
TRIM63Q969Q1 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRIM63Q969Q1 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRIM63Q969Q1 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TRIM63Q969Q1 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
TRIM63Q969Q1 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRIM63Q969Q1 SETP20-201ENST00000457046 852 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRIM63Q969Q1 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRIM63Q969Q1 AC063943.1-201ENST00000465434 453 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRIM63Q969Q1 RN7SL174P-201ENST00000475578 289 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRIM63Q969Q1 AC108062.1-201ENST00000505133 637 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TRIM63Q969Q1 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRIM63Q969Q1 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRIM63Q969Q1 LINC02231-201ENST00000510459 447 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TRIM63Q969Q1 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TRIM63Q969Q1 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TRIM63Q969Q1 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRIM63Q969Q1 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRIM63Q969Q1 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRIM63Q969Q1 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TRIM63Q969Q1 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRIM63Q969Q1 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRIM63Q969Q1 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRIM63Q969Q1 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TRIM63Q969Q1 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRIM63Q969Q1 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
TRIM63Q969Q1 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRIM63Q969Q1 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TRIM63Q969Q1 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRIM63Q969Q1 AC009117.1-201ENST00000563948 554 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRIM63Q969Q1 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TRIM63Q969Q1 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRIM63Q969Q1 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRIM63Q969Q1 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRIM63Q969Q1 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRIM63Q969Q1 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRIM63Q969Q1 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRIM63Q969Q1 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
TRIM63Q969Q1 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRIM63Q969Q1 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.7 ms