Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC3.03□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC3.03□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
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KNOP1Q1ED39 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
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KNOP1Q1ED39 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
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