Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 RPL26P28-201ENST00000451325 435 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 AC108866.1-202ENST00000511064 573 ntTSL 4 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
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CCDC142Q17RM4 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 TRBV8-2-201ENST00000475637 270 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
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CCDC142Q17RM4 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
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CCDC142Q17RM4 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
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