Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 AC069285.2-201ENST00000440210 275 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 LINC02089-201ENST00000412360 682 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
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PTPROQ16827 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
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PTPROQ16827 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
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PTPROQ16827 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
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PTPROQ16827 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 AL592436.1-201ENST00000605135 558 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 LINC01423-201ENST00000414189 608 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
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