Protein–RNA interactions for Protein: Q16777

HIST2H2AC, Histone H2A type 2-C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2ACQ16777 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HIST2H2ACQ16777 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HIST2H2ACQ16777 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HIST2H2ACQ16777 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HIST2H2ACQ16777 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
HIST2H2ACQ16777 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HIST2H2ACQ16777 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HIST2H2ACQ16777 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
HIST2H2ACQ16777 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
HIST2H2ACQ16777 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
HIST2H2ACQ16777 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HIST2H2ACQ16777 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HIST2H2ACQ16777 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
HIST2H2ACQ16777 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HIST2H2ACQ16777 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HIST2H2ACQ16777 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
HIST2H2ACQ16777 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HIST2H2ACQ16777 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HIST2H2ACQ16777 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HIST2H2ACQ16777 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HIST2H2ACQ16777 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HIST2H2ACQ16777 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HIST2H2ACQ16777 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HIST2H2ACQ16777 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HIST2H2ACQ16777 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HIST2H2ACQ16777 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HIST2H2ACQ16777 AC074327.1-201ENST00000448017 540 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HIST2H2ACQ16777 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HIST2H2ACQ16777 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HIST2H2ACQ16777 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HIST2H2ACQ16777 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HIST2H2ACQ16777 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HIST2H2ACQ16777 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HIST2H2ACQ16777 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HIST2H2ACQ16777 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HIST2H2ACQ16777 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HIST2H2ACQ16777 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HIST2H2ACQ16777 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HIST2H2ACQ16777 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HIST2H2ACQ16777 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HIST2H2ACQ16777 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HIST2H2ACQ16777 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HIST2H2ACQ16777 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HIST2H2ACQ16777 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HIST2H2ACQ16777 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HIST2H2ACQ16777 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HIST2H2ACQ16777 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HIST2H2ACQ16777 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HIST2H2ACQ16777 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HIST2H2ACQ16777 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HIST2H2ACQ16777 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HIST2H2ACQ16777 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HIST2H2ACQ16777 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
HIST2H2ACQ16777 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HIST2H2ACQ16777 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HIST2H2ACQ16777 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
HIST2H2ACQ16777 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
HIST2H2ACQ16777 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
HIST2H2ACQ16777 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
HIST2H2ACQ16777 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
HIST2H2ACQ16777 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HIST2H2ACQ16777 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HIST2H2ACQ16777 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HIST2H2ACQ16777 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HIST2H2ACQ16777 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HIST2H2ACQ16777 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HIST2H2ACQ16777 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HIST2H2ACQ16777 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HIST2H2ACQ16777 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
HIST2H2ACQ16777 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HIST2H2ACQ16777 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HIST2H2ACQ16777 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HIST2H2ACQ16777 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HIST2H2ACQ16777 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HIST2H2ACQ16777 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
HIST2H2ACQ16777 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
HIST2H2ACQ16777 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HIST2H2ACQ16777 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HIST2H2ACQ16777 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC3.43□□□□□ -1.86
HIST2H2ACQ16777 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
HIST2H2ACQ16777 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HIST2H2ACQ16777 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HIST2H2ACQ16777 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
HIST2H2ACQ16777 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HIST2H2ACQ16777 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HIST2H2ACQ16777 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC3.43□□□□□ -1.86
HIST2H2ACQ16777 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
HIST2H2ACQ16777 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
HIST2H2ACQ16777 GLYCAM1-202ENST00000546607 553 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
HIST2H2ACQ16777 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
HIST2H2ACQ16777 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HIST2H2ACQ16777 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HIST2H2ACQ16777 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HIST2H2ACQ16777 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
HIST2H2ACQ16777 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
HIST2H2ACQ16777 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HIST2H2ACQ16777 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
HIST2H2ACQ16777 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
HIST2H2ACQ16777 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC3.43□□□□□ -1.86
HIST2H2ACQ16777 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.6 ms