Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AC103706.2-201ENST00000638080 240 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AC110760.3-202ENST00000515177 371 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.6 ms