Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AP003485.2-201ENST00000623636 610 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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