Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 LINC02066-201ENST00000492731 580 ntTSL 4 BASIC1.95□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 AC087855.1-201ENST00000518178 430 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 AC103853.1-201ENST00000520588 649 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 AC084706.1-201ENST00000521879 558 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC1.95□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 AC126365.2-201ENST00000580630 379 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 CFAP221-215ENST00000598644 1532 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 TEX41-203ENST00000420472 765 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
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VAMP3Q15836 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
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VAMP3Q15836 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 MLECP1-201ENST00000615893 709 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.93□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 SPHAR-201ENST00000366688 648 ntAPPRIS P1 BASIC1.93□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
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