Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 CTTNBP2NL-201ENST00000271277 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
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