Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC3.68□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC3.68□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.5 ms