Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 HIGD1AP14-201ENST00000507617 282 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
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TRIM25Q14258 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 EIF4EBP2P1-201ENST00000450009 343 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
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TRIM25Q14258 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 AC004704.1-201ENST00000511219 583 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 ARL6IP1P1-201ENST00000545836 610 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 MIR4443-201ENST00000585052 53 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 TEX41-238ENST00000604253 709 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 DTWD1-201ENST00000251250 13776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
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