Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 ST7-AS2-203ENST00000434993 918 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 AC013565.1-201ENST00000565938 597 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 AP005264.7-201ENST00000625003 745 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AC084768.1-201ENST00000518926 923 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AC012417.1-201ENST00000582307 1039 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.5 ms