Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.02□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 AC103833.1-201ENST00000517442 172 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 BX322635.1-201ENST00000605804 496 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC1.02□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC1.02□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 MIR365B-201ENST00000362317 111 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 AC092902.1-201ENST00000486999 259 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 AC108748.1-201ENST00000487772 515 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 AC084373.1-201ENST00000603311 235 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 PDCD5P1-201ENST00000543528 309 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 AC112503.2-201ENST00000609005 552 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC1□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 LINC00446-201ENST00000414743 459 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 AC115618.2-201ENST00000453810 450 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC0.99□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC0.99□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 SKP1-208ENST00000521216 899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 OR8H1-201ENST00000313022 1038 ntAPPRIS P2 BASIC0.98□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 AC007495.2-201ENST00000562822 459 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 MIR5589-201ENST00000579442 60 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 AC104984.2-201ENST00000582938 385 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 CNOT6LP1-201ENST00000559681 1462 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC0.97□□□□□ -2.25
SPTAN1Q13813 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
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