Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ATRQ13535 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
ATRQ13535 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
ATRQ13535 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
ATRQ13535 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ATRQ13535 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ATRQ13535 ARL5AP2-201ENST00000444698 533 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ATRQ13535 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
ATRQ13535 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
ATRQ13535 CFTRP1-201ENST00000456646 183 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ATRQ13535 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
ATRQ13535 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ATRQ13535 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ATRQ13535 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ATRQ13535 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ATRQ13535 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
ATRQ13535 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
ATRQ13535 AL136520.1-201ENST00000600311 1322 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ATRQ13535 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ATRQ13535 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
ATRQ13535 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC1.04□□□□□ -2.24
ATRQ13535 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ATRQ13535 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ATRQ13535 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ATRQ13535 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
ATRQ13535 Z85994.2-201ENST00000434327 452 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ATRQ13535 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
ATRQ13535 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ATRQ13535 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ATRQ13535 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ATRQ13535 AC023050.1-201ENST00000498198 304 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ATRQ13535 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
ATRQ13535 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ATRQ13535 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
ATRQ13535 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ATRQ13535 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ATRQ13535 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ATRQ13535 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
ATRQ13535 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ATRQ13535 ATP6V1G3-202ENST00000309309 678 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
ATRQ13535 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ATRQ13535 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
ATRQ13535 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
ATRQ13535 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ATRQ13535 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ATRQ13535 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
ATRQ13535 AC089999.1-201ENST00000460336 374 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ATRQ13535 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ATRQ13535 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
ATRQ13535 LINC02488-201ENST00000504287 652 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
ATRQ13535 OR5H4P-201ENST00000510851 923 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ATRQ13535 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
ATRQ13535 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
ATRQ13535 BX322635.1-201ENST00000605804 496 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ATRQ13535 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ATRQ13535 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ATRQ13535 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ATRQ13535 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ATRQ13535 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
ATRQ13535 RNU6-670P-201ENST00000364312 104 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ATRQ13535 CFHR2-201ENST00000367415 1059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
ATRQ13535 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
ATRQ13535 CLIC4P1-201ENST00000453177 535 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ATRQ13535 CFHR2-203ENST00000476712 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
ATRQ13535 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ATRQ13535 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ATRQ13535 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ATRQ13535 AC074029.2-201ENST00000551045 634 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ATRQ13535 AC010735.1-201ENST00000567305 1026 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ATRQ13535 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ATRQ13535 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ATRQ13535 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ATRQ13535 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ATRQ13535 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
ATRQ13535 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ATRQ13535 AC004854.1-201ENST00000440356 349 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ATRQ13535 AL353898.1-201ENST00000444055 238 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ATRQ13535 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ATRQ13535 AL121839.1-201ENST00000556233 1185 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ATRQ13535 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ATRQ13535 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ATRQ13535 AC010200.2-201ENST00000605098 235 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ATRQ13535 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ATRQ13535 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
ATRQ13535 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ATRQ13535 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ATRQ13535 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ATRQ13535 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ATRQ13535 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
ATRQ13535 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ATRQ13535 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
ATRQ13535 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ATRQ13535 AP000857.2-201ENST00000532123 419 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
ATRQ13535 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC1.02□□□□□ -2.25
ATRQ13535 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
ATRQ13535 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ATRQ13535 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
ATRQ13535 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ATRQ13535 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC1.02□□□□□ -2.25
ATRQ13535 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
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