Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 AL136520.1-201ENST00000600311 1322 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 MTND4P8-201ENST00000514997 1362 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
GRIN2BQ13224 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 DPYD-AS2-201ENST00000422259 788 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 LINC02270-201ENST00000505386 610 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 Z86062.1-201ENST00000406773 777 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 AL512504.1-201ENST00000415494 778 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 LINC01967-202ENST00000437506 515 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 LINC01765-201ENST00000448680 491 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 AL592161.1-201ENST00000456389 861 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 CIR1P1-201ENST00000524055 1133 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 AP003110.1-201ENST00000526976 717 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 AC004865.1-201ENST00000442276 1003 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 MTCO1P31-201ENST00000506355 492 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 C1GALT1P2-201ENST00000510813 1104 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 HMGB1P46-201ENST00000520062 610 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 AC242628.1-201ENST00000606810 391 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 AC018618.2-201ENST00000604770 446 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 AC011374.2-201ENST00000607135 526 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 ZBTB8OS-205ENST00000465588 548 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 AC006148.2-201ENST00000467017 650 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 SNORA31.13-201ENST00000516624 135 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 AC242426.3-203ENST00000606757 712 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms