Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 AC093730.1-201ENST00000508825 448 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC2.17□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 GYG2-AS1-201ENST00000445107 515 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC2.16□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC2.16□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 AC009097.3-201ENST00000563557 1018 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC2.15□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ERCC8Q13216 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.4 ms