Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
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TRAF3Q13114 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
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TRAF3Q13114 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
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TRAF3Q13114 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 NAMPT-202ENST00000354289 1213 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
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