Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 AC098587.1-201ENST00000508241 540 ntTSL 4 BASIC4.44□□□□□ -1.7
STRN3Q13033 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
STRN3Q13033 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
STRN3Q13033 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
STRN3Q13033 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
STRN3Q13033 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
STRN3Q13033 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
STRN3Q13033 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
STRN3Q13033 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
STRN3Q13033 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
STRN3Q13033 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
STRN3Q13033 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
STRN3Q13033 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
STRN3Q13033 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
STRN3Q13033 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
STRN3Q13033 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
STRN3Q13033 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
STRN3Q13033 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
STRN3Q13033 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
STRN3Q13033 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
STRN3Q13033 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
STRN3Q13033 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
STRN3Q13033 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
STRN3Q13033 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC4.44□□□□□ -1.7
STRN3Q13033 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
STRN3Q13033 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
STRN3Q13033 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
STRN3Q13033 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
STRN3Q13033 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
STRN3Q13033 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
STRN3Q13033 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
STRN3Q13033 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
STRN3Q13033 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
STRN3Q13033 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
STRN3Q13033 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC4.43□□□□□ -1.7
STRN3Q13033 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
STRN3Q13033 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
STRN3Q13033 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
STRN3Q13033 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
STRN3Q13033 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
STRN3Q13033 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
STRN3Q13033 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
STRN3Q13033 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
STRN3Q13033 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
STRN3Q13033 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
STRN3Q13033 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
STRN3Q13033 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
STRN3Q13033 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
STRN3Q13033 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
STRN3Q13033 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
STRN3Q13033 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
STRN3Q13033 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
STRN3Q13033 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
STRN3Q13033 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
STRN3Q13033 AC068672.1-201ENST00000520391 328 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
STRN3Q13033 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
STRN3Q13033 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC4.43□□□□□ -1.7
STRN3Q13033 ARL6IP1P1-201ENST00000545836 610 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
STRN3Q13033 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
STRN3Q13033 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
STRN3Q13033 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
STRN3Q13033 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
STRN3Q13033 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
STRN3Q13033 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
STRN3Q13033 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
STRN3Q13033 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
STRN3Q13033 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
STRN3Q13033 ALG13-230ENST00000623189 458 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
STRN3Q13033 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
STRN3Q13033 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
STRN3Q13033 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
STRN3Q13033 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
STRN3Q13033 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
STRN3Q13033 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
STRN3Q13033 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
STRN3Q13033 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
STRN3Q13033 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
STRN3Q13033 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
STRN3Q13033 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
STRN3Q13033 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
STRN3Q13033 AL121877.1-201ENST00000453704 622 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
STRN3Q13033 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
STRN3Q13033 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
STRN3Q13033 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
STRN3Q13033 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC4.42□□□□□ -1.7
STRN3Q13033 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
STRN3Q13033 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
STRN3Q13033 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
STRN3Q13033 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
STRN3Q13033 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
STRN3Q13033 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
STRN3Q13033 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
STRN3Q13033 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
STRN3Q13033 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
STRN3Q13033 AL049634.3-201ENST00000604968 457 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
STRN3Q13033 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
STRN3Q13033 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
STRN3Q13033 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
STRN3Q13033 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
STRN3Q13033 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 162.7 ms