Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
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