Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 AP003072.5-201ENST00000623872 773 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 AL358975.1-202ENST00000628133 589 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 MTCO1P4-201ENST00000520516 1409 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 AC111000.5-201ENST00000506559 1178 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 AC090525.3-201ENST00000605601 189 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 CEP290-202ENST00000397838 2421 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 SNORD65-201ENST00000391079 73 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 FABP5P3-201ENST00000437960 408 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 AC112503.2-201ENST00000609005 552 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 AC025016.1-201ENST00000616746 682 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 OR4V1P-201ENST00000525394 1140 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 LINC02301-201ENST00000553760 773 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 MTND2P26-201ENST00000528255 1029 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
GRIN2AQ12879 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
GRIN2AQ12879 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
GRIN2AQ12879 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
GRIN2AQ12879 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GRIN2AQ12879 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GRIN2AQ12879 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GRIN2AQ12879 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GRIN2AQ12879 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
GRIN2AQ12879 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GRIN2AQ12879 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GRIN2AQ12879 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC2.14□□□□□ -2.07
GRIN2AQ12879 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
GRIN2AQ12879 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GRIN2AQ12879 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.7 ms