Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 RNU6-889P-201ENST00000517189 103 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 C1DP5-201ENST00000525775 383 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 AP003110.1-201ENST00000526976 717 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 BNIP3P7-201ENST00000605641 516 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 RNU6-670P-201ENST00000364312 104 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 AL358972.1-201ENST00000434356 466 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 C1orf143-201ENST00000443836 762 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 AC092685.1-201ENST00000447960 1243 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 AC115989.2-201ENST00000578640 563 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 LINC01878-201ENST00000434559 769 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 TH2LCRR-202ENST00000435042 472 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 AC020559.1-201ENST00000444229 583 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 AP002345.1-201ENST00000456493 928 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 ZNF736P6Y-201ENST00000447526 1213 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
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