Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 LINC02270-201ENST00000505386 610 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 OR4H6P-202ENST00000603819 340 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 AL121978.1-201ENST00000402778 359 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 AL671309.1-201ENST00000603750 544 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 AC026741.1-201ENST00000605892 482 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 AL161616.2-201ENST00000622001 565 ntTSL 4 BASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 MTND5P11-201ENST00000511037 1812 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 VN1R42P-201ENST00000424651 344 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
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PTPRBP23467 RPL32P14-201ENST00000463196 378 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 AC015908.1-201ENST00000478739 476 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
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PTPRBP23467 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 CR848007.2-201ENST00000424918 787 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
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PTPRBP23467 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
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PTPRBP23467 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 AP006248.3-201ENST00000623580 594 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
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