Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
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ERVV-1B6SEH8 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 snoU109.3-201ENST00000459477 145 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 AL022067.1-201ENST00000602426 454 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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