Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
VAX2Q9UIW0 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
VAX2Q9UIW0 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
VAX2Q9UIW0 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
VAX2Q9UIW0 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
VAX2Q9UIW0 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
VAX2Q9UIW0 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
VAX2Q9UIW0 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
VAX2Q9UIW0 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
VAX2Q9UIW0 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
VAX2Q9UIW0 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
VAX2Q9UIW0 AC004217.2-201ENST00000547401 751 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
VAX2Q9UIW0 AC104072.1-201ENST00000568817 668 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
VAX2Q9UIW0 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
VAX2Q9UIW0 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
VAX2Q9UIW0 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
VAX2Q9UIW0 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
VAX2Q9UIW0 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
VAX2Q9UIW0 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
VAX2Q9UIW0 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
VAX2Q9UIW0 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
VAX2Q9UIW0 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
VAX2Q9UIW0 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
VAX2Q9UIW0 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
VAX2Q9UIW0 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC2.09□□□□□ -2.07
VAX2Q9UIW0 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
VAX2Q9UIW0 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
VAX2Q9UIW0 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
VAX2Q9UIW0 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
VAX2Q9UIW0 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
VAX2Q9UIW0 RNU6-298P-201ENST00000390888 96 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
VAX2Q9UIW0 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
VAX2Q9UIW0 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
VAX2Q9UIW0 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
VAX2Q9UIW0 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
VAX2Q9UIW0 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
VAX2Q9UIW0 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
VAX2Q9UIW0 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
VAX2Q9UIW0 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
VAX2Q9UIW0 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
VAX2Q9UIW0 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
VAX2Q9UIW0 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
VAX2Q9UIW0 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
VAX2Q9UIW0 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
VAX2Q9UIW0 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
VAX2Q9UIW0 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
VAX2Q9UIW0 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
VAX2Q9UIW0 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
VAX2Q9UIW0 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
VAX2Q9UIW0 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
VAX2Q9UIW0 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
VAX2Q9UIW0 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
VAX2Q9UIW0 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC2.09□□□□□ -2.07
VAX2Q9UIW0 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
VAX2Q9UIW0 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
VAX2Q9UIW0 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC2.09□□□□□ -2.07
VAX2Q9UIW0 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC2.09□□□□□ -2.07
VAX2Q9UIW0 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
VAX2Q9UIW0 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
VAX2Q9UIW0 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
VAX2Q9UIW0 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
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VAX2Q9UIW0 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
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VAX2Q9UIW0 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
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VAX2Q9UIW0 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
VAX2Q9UIW0 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
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VAX2Q9UIW0 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
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VAX2Q9UIW0 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 AC084706.1-201ENST00000521879 558 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
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