Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 AC092608.3-201ENST00000625017 386 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 DNAH14-203ENST00000366848 929 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 TRIM60P5Y-201ENST00000413946 574 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 UBE2D3P3-201ENST00000426992 425 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 RPL32P14-201ENST00000463196 378 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 LINC01612-201ENST00000504509 469 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 LINC00871-202ENST00000556071 554 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 AC138907.2-201ENST00000561479 866 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 AC145350.4-201ENST00000562827 866 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 AC133485.5-201ENST00000563407 866 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 FABP5P3-201ENST00000437960 408 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 AL353148.1-203ENST00000452286 665 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 CEP70-205ENST00000464035 1054 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 ZBTB8OS-205ENST00000465588 548 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 AC121161.1-201ENST00000510606 652 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 AC069439.2-201ENST00000496403 789 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 AC008628.1-201ENST00000508663 265 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 AL136520.1-202ENST00000555494 763 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.5 ms