Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
C9orf135Q5VTT2 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
C9orf135Q5VTT2 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
C9orf135Q5VTT2 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
C9orf135Q5VTT2 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
C9orf135Q5VTT2 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
C9orf135Q5VTT2 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
C9orf135Q5VTT2 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
C9orf135Q5VTT2 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
C9orf135Q5VTT2 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
C9orf135Q5VTT2 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
C9orf135Q5VTT2 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
C9orf135Q5VTT2 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
C9orf135Q5VTT2 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
C9orf135Q5VTT2 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
C9orf135Q5VTT2 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
C9orf135Q5VTT2 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
C9orf135Q5VTT2 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
C9orf135Q5VTT2 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
C9orf135Q5VTT2 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
C9orf135Q5VTT2 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
C9orf135Q5VTT2 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
C9orf135Q5VTT2 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
C9orf135Q5VTT2 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
C9orf135Q5VTT2 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
C9orf135Q5VTT2 AC036101.1-201ENST00000449272 597 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
C9orf135Q5VTT2 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
C9orf135Q5VTT2 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
C9orf135Q5VTT2 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
C9orf135Q5VTT2 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
C9orf135Q5VTT2 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
C9orf135Q5VTT2 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
C9orf135Q5VTT2 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
C9orf135Q5VTT2 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
C9orf135Q5VTT2 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
C9orf135Q5VTT2 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
C9orf135Q5VTT2 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
C9orf135Q5VTT2 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
C9orf135Q5VTT2 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
C9orf135Q5VTT2 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
C9orf135Q5VTT2 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
C9orf135Q5VTT2 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
C9orf135Q5VTT2 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
C9orf135Q5VTT2 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
C9orf135Q5VTT2 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
C9orf135Q5VTT2 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
C9orf135Q5VTT2 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
C9orf135Q5VTT2 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
C9orf135Q5VTT2 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
C9orf135Q5VTT2 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
C9orf135Q5VTT2 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
C9orf135Q5VTT2 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
C9orf135Q5VTT2 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
C9orf135Q5VTT2 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.02
C9orf135Q5VTT2 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
C9orf135Q5VTT2 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC2.4□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 TMEM161B-210ENST00000511218 1351 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
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