Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
KNOP1Q1ED39 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
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