Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 AC090281.1-201ENST00000523019 276 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 PPIAP17-201ENST00000438507 471 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
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CCDC142Q17RM4 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
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CCDC142Q17RM4 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
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CCDC142Q17RM4 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
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CCDC142Q17RM4 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 AC078899.5-201ENST00000612475 178 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 SKP1P1-201ENST00000438081 489 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
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