Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 STARD13-AS-208ENST00000589472 859 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 MTCO1P18-201ENST00000455518 1419 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 TAF9BP2-201ENST00000400856 499 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 MTCO1P57-201ENST00000432182 261 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 HMGN1P5-201ENST00000448591 263 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 MTCO3P42-201ENST00000509488 518 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 MTCO3P39-201ENST00000514812 518 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 RNU5A-7P-201ENST00000515979 116 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 EIF1AXP2-201ENST00000555940 413 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 ETFRF1-208ENST00000556402 874 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 AC106734.1-201ENST00000568646 663 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 SNORA27.3-201ENST00000364937 134 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC1.6□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC1.6□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC1.6□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 TRAV11-201ENST00000539512 339 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 AF131215.7-201ENST00000602443 707 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 RNU6-40P-201ENST00000384254 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 OR9N1P-202ENST00000494289 481 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 OR6C68-201ENST00000548615 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.59□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 ATP5F1P7-201ENST00000567330 760 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
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