| UPP1 | Q16831 | SNORD116-1-201 | ENST00000384335 | 95 nt | BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| UPP1 | Q16831 | MTCYBP36-201 | ENST00000404146 | 440 nt | BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| UPP1 | Q16831 | CUL3-204 | ENST00000409777 | 3147 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC091705.1-201 | ENST00000412197 | 209 nt | TSL 5 BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| UPP1 | Q16831 | AL391704.1-203 | ENST00000414903 | 462 nt | TSL 3 BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC013401.1-202 | ENST00000422017 | 626 nt | TSL 2 BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| UPP1 | Q16831 | AL139281.1-201 | ENST00000422120 | 335 nt | BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| UPP1 | Q16831 | AL365338.1-201 | ENST00000422282 | 858 nt | BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| UPP1 | Q16831 | AL683807.1-202 | ENST00000432272 | 382 nt | TSL 2 BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC087499.2-201 | ENST00000432861 | 149 nt | BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC104653.2-201 | ENST00000435407 | 416 nt | TSL 3 BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| UPP1 | Q16831 | AL512286.1-201 | ENST00000439244 | 400 nt | BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC118469.1-201 | ENST00000442943 | 488 nt | BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| UPP1 | Q16831 | UQCRHP3-201 | ENST00000451503 | 251 nt | BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| UPP1 | Q16831 | WDFY3-AS2-202 | ENST00000451762 | 5814 nt | TSL 3 BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC010285.1-201 | ENST00000470580 | 392 nt | BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| UPP1 | Q16831 | KCTD9P5-201 | ENST00000504141 | 1170 nt | BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC022447.3-201 | ENST00000506865 | 495 nt | BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| UPP1 | Q16831 | MTCO2P32-201 | ENST00000514865 | 403 nt | BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| UPP1 | Q16831 | RN7SKP43-201 | ENST00000516173 | 320 nt | BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| UPP1 | Q16831 | FAM60DP-201 | ENST00000524174 | 632 nt | BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC079600.2-201 | ENST00000550076 | 130 nt | BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC069029.1-201 | ENST00000558736 | 263 nt | TSL 2 BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| UPP1 | Q16831 | RPL12P50-201 | ENST00000603116 | 116 nt | BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| UPP1 | Q16831 | AL358072.1-201 | ENST00000604156 | 575 nt | BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| UPP1 | Q16831 | BCRP9-201 | ENST00000605312 | 388 nt | BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC007998.5-201 | ENST00000622938 | 237 nt | BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC004972.1-201 | ENST00000623934 | 2209 nt | BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| UPP1 | Q16831 | FIGNL1-202 | ENST00000395556 | 3485 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC091152.2-201 | ENST00000591628 | 2569 nt | BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| UPP1 | Q16831 | FKTN-209 | ENST00000602661 | 2576 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| UPP1 | Q16831 | MUC7-202 | ENST00000413702 | 2540 nt | APPRIS P2 TSL 4 BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC006378.2-201 | ENST00000623178 | 2476 nt | BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| UPP1 | Q16831 | DMD-203 | ENST00000357033 | 13956 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| UPP1 | Q16831 | MCF2-208 | ENST00000519895 | 3346 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| UPP1 | Q16831 | ATP8A2P3-201 | ENST00000426792 | 1536 nt | BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| UPP1 | Q16831 | RICTOR-201 | ENST00000296782 | 7505 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| UPP1 | Q16831 | ZNF567-201 | ENST00000360729 | 2691 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| UPP1 | Q16831 | AL513185.3-201 | ENST00000433335 | 1300 nt | BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNU6-97P-201 | ENST00000363387 | 104 nt | BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNU6-769P-201 | ENST00000384407 | 104 nt | BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| UPP1 | Q16831 | MIR1305-201 | ENST00000408300 | 86 nt | BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNA5SP129-201 | ENST00000410276 | 118 nt | BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNA5SP293-201 | ENST00000410527 | 113 nt | BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| UPP1 | Q16831 | Z99497.1-201 | ENST00000421282 | 135 nt | BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| UPP1 | Q16831 | RPS27AP14-201 | ENST00000422868 | 454 nt | BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| UPP1 | Q16831 | USP9YP36-201 | ENST00000424581 | 829 nt | BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| UPP1 | Q16831 | SETP8-201 | ENST00000435341 | 628 nt | BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| UPP1 | Q16831 | AL121957.1-201 | ENST00000441532 | 338 nt | TSL 2 BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC125238.1-201 | ENST00000448842 | 249 nt | BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| UPP1 | Q16831 | HMGB3P8-201 | ENST00000449709 | 577 nt | BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| UPP1 | Q16831 | AL122001.1-201 | ENST00000457027 | 370 nt | BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC004930.1-201 | ENST00000470677 | 254 nt | TSL 2 BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| UPP1 | Q16831 | AL049830.2-201 | ENST00000480072 | 201 nt | BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC093278.1-201 | ENST00000494700 | 600 nt | BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| UPP1 | Q16831 | OR5BM1P-201 | ENST00000512021 | 366 nt | BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC079160.1-201 | ENST00000513489 | 739 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| UPP1 | Q16831 | LINC02364-201 | ENST00000514802 | 687 nt | TSL 2 BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| UPP1 | Q16831 | SNORA31.20-201 | ENST00000517111 | 133 nt | BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| UPP1 | Q16831 | CR383656.7-201 | ENST00000548164 | 174 nt | BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC007610.2-201 | ENST00000566770 | 666 nt | TSL 3 BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC012186.2-201 | ENST00000569353 | 321 nt | TSL 3 BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC106796.1-201 | ENST00000577173 | 615 nt | TSL 3 BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC037487.2-201 | ENST00000581796 | 537 nt | TSL 3 BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| UPP1 | Q16831 | PIGPP4-201 | ENST00000584447 | 307 nt | BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| UPP1 | Q16831 | ZNF573-209 | ENST00000585724 | 453 nt | TSL 5 BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC027514.2-201 | ENST00000591014 | 637 nt | TSL 3 BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| UPP1 | Q16831 | U73023.1-201 | ENST00000603134 | 700 nt | BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC073114.1-201 | ENST00000612027 | 490 nt | BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| UPP1 | Q16831 | AL356585.4-201 | ENST00000623078 | 1229 nt | BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| UPP1 | Q16831 | CD44-239 | ENST00000639002 | 528 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| UPP1 | Q16831 | ASPN-201 | ENST00000375543 | 2237 nt | TSL 2 BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| UPP1 | Q16831 | EYS-204 | ENST00000370621 | 10485 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| UPP1 | Q16831 | ERBIN-204 | ENST00000380943 | 6410 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC092447.10-201 | ENST00000620607 | 1652 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| UPP1 | Q16831 | BCLAF3-202 | ENST00000379682 | 3217 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| UPP1 | Q16831 | GCNT4-201 | ENST00000322348 | 5554 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| UPP1 | Q16831 | ISPD-AS1-202 | ENST00000438573 | 2252 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| UPP1 | Q16831 | FBXL13-204 | ENST00000436908 | 2577 nt | TSL 5 BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNA5SP295-201 | ENST00000362655 | 121 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNU4-40P-201 | ENST00000364351 | 143 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| UPP1 | Q16831 | RFPL3S-202 | ENST00000382086 | 455 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| UPP1 | Q16831 | PPP1R1C-203 | ENST00000409702 | 1157 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC079780.1-201 | ENST00000428259 | 207 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| UPP1 | Q16831 | AL596220.1-202 | ENST00000429768 | 314 nt | TSL 3 BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| UPP1 | Q16831 | LINC00392-201 | ENST00000430033 | 557 nt | TSL 3 BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC129850.1-201 | ENST00000436203 | 508 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| UPP1 | Q16831 | GDI2P2-201 | ENST00000445131 | 608 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| UPP1 | Q16831 | RPS24P6-201 | ENST00000452670 | 400 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| UPP1 | Q16831 | RN7SL330P-201 | ENST00000469709 | 307 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| UPP1 | Q16831 | AP002884.2-201 | ENST00000471647 | 395 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| UPP1 | Q16831 | APOA2-210 | ENST00000491350 | 263 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| UPP1 | Q16831 | OCIAD1-AS1-201 | ENST00000513576 | 265 nt | TSL 3 BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC017037.2-201 | ENST00000513850 | 890 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC117532.1-201 | ENST00000514638 | 323 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC116347.2-201 | ENST00000514912 | 523 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC090796.1-201 | ENST00000520370 | 567 nt | TSL 4 BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| UPP1 | Q16831 | OR5M10-201 | ENST00000526812 | 1052 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC091534.1-202 | ENST00000549953 | 468 nt | TSL 5 BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| UPP1 | Q16831 | AL359237.1-201 | ENST00000554305 | 826 nt | TSL 5 BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |