Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.69
PTPROQ16827 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 AC010601.1-202ENST00000567304 547 ntTSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
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